Nigéria : des bébés naissent avec des bactéries résistantes aux antibiotiques

La septicémie survient lorsque le système immunitaire réagit de manière extrême à une infection. C’est une maladie potentiellement mortelle : à l’échelle mondiale, elle est responsable d’environ 11 millions de décès, soit 20 % de tous les décès par an.

Et cela ne touche pas seulement les adultes. En 2020, 2,4 millions de nouveau -nés sont morts d’ une septicémie au cours du premier mois de leur vie. La plupart de ces décès ont eu lieu en Afrique subsaharienne.

Le principal traitement du sepsis est l’administration d’antibiotiques. Cependant, l’utilisation excessive et abusive d’antibiotiques en médecine humaine et en agriculture a conduit à une résistance aux antimicrobiens, un processus au cours duquel les bactéries, les champignons et les parasites ont développé la capacité de résister à l’action des médicaments.

L’Organisation mondiale de la santé décrit la résistance aux antimicrobiens comme l’une des principales menaces pour la santé publique et le développement à l’échelle mondiale.

Cette résistance croissante est due à la surconsommation et à l’usage abusif des antibiotiques, tant en médecine humaine qu’en agriculture. Ils sont utilisés en grandes quantités pour faire pousser des cultures et dans les aliments pour animaux afin de traiter et de réduire le risque d’infection du bétail.

On prévoit que, d’ici 2050 , davantage de personnes mourront de la résistance aux antimicrobiens que du cancer et du diabète réunis.

L’Afrique subsaharienne est l’une des régions du monde où les taux de décès liés à la résistance aux antimicrobiens (y compris la septicémie) sont les plus élevés, avec 23,5 décès pour 100 000 personnes.

La colistine est l’un des derniers antibiotiques encore efficaces pour tuer les bactéries et lutter contre les infections telles que la pneumonie. Elle est considérée comme d’une importance cruciale pour la médecine humaine par l’Organisation mondiale de la santé.

Les mères ont pu attraper ces bactéries résistantes à la colistine dans leur environnement. Nous ne pouvons pas spéculer sur le mécanisme précis. Les bébés, quant à eux, pourraient avoir attrapé les bactéries à l’hôpital, dans la communauté ou auprès de leur mère. On ne sait pas encore si ces bactéries résistantes à la colistine restent dans l’organisme de la mère ou de l’enfant, mais si tel est le cas, cela pourrait augmenter leurs risques de contracter de futures infections résistantes aux médicaments.

Les échantillons de nouveau-nés et de leurs mères dans notre étude ont été collectés entre 2015 et 2017 dans trois hôpitaux de Kano et d’Abuja. Cette recherche constitue la plus grande étude jamais réalisée sur le microbiote intestinal pour détecter la résistance à la colistine au Nigéria.

Sur les 4 907 échantillons analysés dans nos laboratoires de Cardiff et d’Oxford, nous avons constaté que 1 % des échantillons contenaient des gènes conférant une résistance à la colistine, chez 41 mères et huit bébés. Bien que ce pourcentage soit faible, il est extrêmement inquiétant que des bébés soient porteurs de bactéries résistantes à la colistine au cours de leur première semaine de vie.

La colistine est rarement utilisée dans les hôpitaux et les cliniques au Nigéria. Par conséquent, nos résultats suggèrent que la résistance pourrait être apparue en raison de l’utilisation croissante de la colistine dans les milieux agricoles du pays. Nous poursuivons nos recherches avec des collaborateurs au Nigéria pour mieux comprendre les niveaux de résistance dans le système de santé et plus largement.

Les dangers de l’utilisation des antibiotiques dans l’agriculture

À l’échelle mondiale, on prescrit davantage d’antibiotiques aux animaux qu’aux humains. La plupart de ces antibiotiques ne sont pas utilisés pour traiter des infections, mais plutôt pour prévenir les infections ou favoriser une croissance plus rapide des animaux.

En 2016, des gènes de colistine mobile (mcr) ont été découverts chez des bactéries E. coli provenant d’un élevage porcin en Chine. Ces gènes sont porteurs d’une résistance à l’antibiotique colistine et peuvent se propager entre les bactéries, renforçant ainsi la résistance à la colistine.

Cette découverte a conduit à une interdiction totale de l’utilisation agricole de la colistine en Chine .

En février 2022, les lois européennes ont été élargies pour rendre illégal l’ajout d’antibiotiques aux aliments du bétail par mesure de précaution pour prévenir les infections avant qu’elles ne commencent.

Cependant, dans une étude que nous avons publiée en 2023, nous avons constaté que, bien que les pays européens aient interdit l’utilisation de la colistine dans l’agriculture, ils exportent paradoxalement toujours activement des aliments pour bétail contenant de la colistine vers des pays à revenu faible et intermédiaire comme le Nigéria pour une utilisation agricole.

Il semble très discutable de tirer profit sciemment de la vente d’aliments interdits d’utilisation en Europe à des pays en développement qui ne disposent pas de ces réglementations – en particulier lorsque ces pays souffrent déjà de certains des taux les plus élevés au monde de résistance endémique aux antimicrobiens pour les antibiotiques courants et que les alternatives de traitement sont soit excessivement coûteuses, soit complètement inaccessibles.

Selon les estimations, près de 100 000 tonnes d’antibiotiques ont été utilisées dans le monde pour élever des bovins, des moutons, des poulets et des porcs en 2022. Cette utilisation devrait augmenter de 8 % supplémentaires d’ici 2030 et entraînera une augmentation directe des infections résistantes aux antibiotiques.

Appel à une interdiction totale

Il est nécessaire d’interdire à l’échelle mondiale l’utilisation inconsidérée de la colistine dans l’agriculture afin de préserver cet antibiotique crucial pour les cas où il sera nécessaire de toute urgence.

Il s’agit toutefois d’un équilibre délicat. Une interdiction sans solutions alternatives risque d’affecter la production alimentaire et de nuire aux moyens de subsistance des agriculteurs dans des conditions climatiques déjà difficiles. Et comme la population mondiale devrait augmenter d’environ 2 milliards d’ici 2050 , la demande de viande à prix abordable ne fera qu’augmenter.

Il est également nécessaire d’investir d’urgence dans les programmes de prévention et de contrôle des infections hospitalières et dans l’amélioration des installations d’eau, d’assainissement et d’hygiène dans les exploitations agricoles afin de contribuer à limiter la propagation de bactéries résistantes aux antibiotiques dans ces environnements.

Les animaux ne doivent recevoir des antibiotiques que lorsqu’ils sont malades. Ces antibiotiques doivent être choisis parmi ceux que l’Organisation mondiale de la santé considère comme étant « les moins importants » pour la santé humaine plutôt que parmi ceux classés comme « de la plus haute priorité/d’une importance critique ».

En septembre 2024, lors de l’Assemblée générale des Nations Unies à New York, les dirigeants des gouvernements, de l’industrie, des institutions financières et des organisations scientifiques se réuniront pour une réunion de haut niveau des Nations Unies sur la résistance aux antimicrobiens .

Cette réunion offre une occasion opportune aux dirigeants mondiaux de fixer des objectifs visant à réduire l’utilisation d’antibiotiques dans l’agriculture et à aider les agriculteurs des pays à revenu faible et intermédiaire à améliorer les pratiques d’hygiène agricole.

Owen Spiller

Chef du département de microbiologie médicale, Université de Cardiff